HIV将其DNA基因蓝图插入人类细胞的染色体中，并建立了一个抗逆转录病毒药物无法到达的持久储存库。这些所谓的HIV前病毒可以在治疗期间无限期地潜伏在静息的T细胞（主要是CD4辅助细胞）中，但是当抗逆转录病毒药物停止使用时，它们通常会开始产生新的病毒，这使得治愈几乎是不可能的。即使在根据标准测试病毒载量检测不到的人群中，持续的低水平病毒也会引发慢性免疫激活和炎症，从而导致从心血管疾病到认知障碍的各种疾病。
“这是一种欺骗性的休眠病毒，”洛桑大学和蒙特利尔大学的高级研究员Daniel Kaufmann博士在一份新闻稿中说。“即使在接受治疗的人群中，艾滋病毒也继续具有一些活动，并且继续与免疫系统相互作用。我们必须了解这些持续的相互作用是否具有临床相关后果。
在发表在《艾滋病》杂志上的第一项研究中，美国国家过敏和传染病研究所的Hiromi Imamichi博士及其同事探讨了有缺陷的非复制HIV前病毒如何驱动持续的免疫激活和慢性炎症。
该分析包括来自23名艾滋病毒感染者的样本。15例接受抗逆转录病毒治疗（ART）和病毒抑制，平均6年，5例样本是在治疗开始前从人们身上收集的。此外，从他们开始ART之前开始，随着时间的推移收集了三名参与者的样本。
研究人员测量了外周血中的HIV DNA，HIV RNA，HIV抗体以及炎症和凝血（凝血）的关键生物标志物。当病毒复制时，它首先使用前病毒DNA制造RNA模板（转录），然后用于产生病毒蛋白（翻译）。
他们观察到，无论病毒载量如何，所有接受治疗的参与者中，多个转录活性HIV前病毒克隆和针对HIV蛋白的抗体反应都有类似的长期持久性。更重要的是，随着时间的推移采样的参与者在开始治疗并实现病毒抑制后没有显示出任何变化。炎症生物标志物也几乎没有变化，包括白细胞介素6和高灵敏度C反应蛋白。
虽然前病毒是活跃的，但几乎所有病毒似乎都有缺陷，或者无法产生功能性病毒。尽管如此，有缺陷的前病毒转录程度较高的人具有较高的HIV抗体水平，而HIV DNA水平较高的人具有更多的CD8杀伤性T细胞，这表明持续的免疫激活。较高水平的HIV RNA和蛋白质也与D-二聚体升高有关，D-二聚体是炎症和凝血的生物标志物。
“这些发现表明，'有缺陷的'HIV-1前病毒的转录和翻译与在治疗的慢性HIV-1感染环境中看到的持续免疫激活之间存在新的相互作用，”研究作者总结道。
在Cell Host and Microbe中描述的第二项研究中，Kaufmann及其同事分析了18名接受ART治疗超过三年的人的HIV持久性，他们都是白人男性。
使用各种实验室方法，研究人员在接受ART的18人中有14人的CD4细胞中检测到了活跃的HIV转录或RNA产生。虽然这些细胞在很大程度上表现出“流产”转录，表明前病毒有缺陷，但七名参与者（39%）具有表达p24和其他HIV蛋白的细胞。即使是缺少大部分DNA的前病毒仍然可以产生病毒蛋白。更重要的是，具有活性储库的人具有更强的CD4和CD8 T细胞免疫反应。
“我们的数据表明，这些病毒库产生的RNA和蛋白质可能是炎症的驱动因素，”Kaufmann说。“这可能很重要，因为成功接受艾滋病毒抗逆转录病毒治疗的人中有一部分人仍然对感染有负面影响 - 例如，加速心脏病，虚弱和过早骨质疏松症。
在同一期刊上描述的第三项研究中，俄勒冈健康与科学大学疫苗和基因治疗研究所和美国军事HIV研究计划的Lydie Trautmann博士及其同事分析了在急性或慢性HIV感染期间开始ART的人的CD8 T细胞。在开始治疗之前，HIV特异性CD8细胞功能失调且寿命短，研究人员指出这是背景。
参与者几乎都是男性，来自泰国的两个队列。该分析包括48名在急性或最近感染期间开始治疗并接受ART至少两年的人，17名慢性感染者治疗至少两年，17名慢性感染者仅接受ART治疗六个月。研究人群相对年轻，中位年龄在30岁以下，因此不代表长期幸存者。
在这里，尽管有抗逆转录病毒药物，参与者的CD4细胞的一部分仍继续表达HIV RNA，尽管那些在急性感染期间开始ART的细胞产生的病毒蛋白较少。病毒库的大小和CD8 T细胞反应的大小在治疗两年后均下降。总体而言，具有持续HIV特异性CD8细胞反应的人看到整合前病毒的减少更大，但HIV的gag，pol，nef和vif蛋白特异性CD8细胞的大小与更大的活性储库（以细胞相关病毒RNA测量）有关。高HIV DNA水平与维持短寿命HIV特异性CD8 T细胞密切相关，无论治疗是在急性还是慢性感染期间开始的。
“我们的数据表明，活性储库维持HIV特异性CD8 + T细胞大小，但阻止它们分化为功能细胞，”研究作者总结道。
“我们的研究表明，由抗逆转录病毒疗法上的活性HIV储存库驱动的残留免疫功能障碍可能导致分析治疗中断后缺乏病毒控制，通过阻止功能性干样自我更新HIV特异性CD8 + T细胞的分化，这些细胞可以建立有效的快速召回反应，”他们写道。“因此，HIV缓解策略可能需要针对在抗逆转录病毒治疗期间产生病毒蛋白的转录活性前病毒，以利用HIV特异性CD8 + T细胞来控制治疗停止后病毒的反弹。