没有一种药物，或几种药物的组合，对所有人都有效，或永远有效，抗HIV治疗的药物同样如此。有些人，可以长时间坚持一种治疗方案，而有些人则无法降低HIV病毒载量，提高CD4细胞数量，或者耐受第一种治疗方案的副作用。
另一些人则在寻找更简单的治疗方案，这些方案需要更少的药物负担，更少的服药频率或包含更少的药物。维持治疗旨在维持现有的病毒抑制，对于那些在标准的三种药物治疗方案中达到稳定且无法检测到病毒载量的人来说，只使用两种药物现在是一个转换选择。
近年来，治疗选择已经大大扩展和改善。随着对耐药性的更好理解和对耐药病毒的治疗新药的开发，大多数艾滋病毒感染者能够长期控制病毒。
那么，什么情况下需要更换药物?
无论你是刚刚开始抗逆转录病毒治疗，还是已经接受了几年的治疗，以下是一些更换药物的原因：
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HIV病毒载量没有被完全抑制。无法达到或维持无法检测到的病毒载量，被称为治疗失败，在现实中不太常见。然而，一些人仍在服用老药，使用药效较弱的组合，或依从性差。
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CD4细胞恢复差。一些坚持治疗并完全抑制病毒载量的人，他们的CD4计数仍未上升到正常水平，这可能更容易受到机会性疾病的影响。
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难以按时服药。有些人很难坚持他们的HIV疗法。有些药物服用起来更方便，无食物限制或对偶尔错过的剂量更“宽容”。
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服药药片数过多或服药次数过多。艾滋病毒感染者现在可以使用单片治疗方案，即每天服用一粒药。目前长期注射方案已在国外上市。
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短期和长期副作用。如果副作用严重影响到生活质量，那就可以改用耐受性更好的药物。短期副作用包括腹泻、皮疹或睡眠困难；长期影响的例子是血液中胆固醇或葡萄糖的增加，或肝损伤、肾损伤或骨质流失的迹象。
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药物相互作用。一些抗逆转录病毒药物可能与治疗其他疾病的药物相互作用。艾滋病毒感染者可能患有其他慢性感染，如乙肝或丙肝。随着年龄的增长，他们更有可能患上高血压或糖尿病等同样需要治疗的疾病。一些新的艾滋病药物，特别是整合酶抑制剂，不太可能与其他药物相互作用。
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吞咽或食物的需要。对一些人来说，试图吞下一个很大的药片可能是个问题。有些药物必须空腹服用，还有一些必须和食物一起吃，这都造成了时间上的不便。
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怀孕期间使用。怀孕还会改变血液中某些抗逆转录病毒药物的水平。应在受孕前规划适当的治疗方案，并在整个怀孕期间进行监测，以保护母亲和儿童的健康并减少传播风险。
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费用。很多HIV药物陆续进入医保目录，价格越来越亲民，经济条件允许，可以选择服用更方便，耐受性更好的药物。